Neben den kulinarischen Köstlichkeiten und den traumhaften Stränden ist Oaxaca bekannt für seine atemberaubende Natur. Auf circa 17,8 Millionen Hektar erstrecken sich die 150 bundesstaatlichen Naturschutzgebiete.
Zahlreiche Ökotourismusprojekte fördern die Einbindung der Einheimischen in den Erhalt der Natur. Die„Pueblos Mancomunados“ in der Sierra Norte in Oaxaca sind beispielsweise ein Verbund von drei Gemeinden mit acht zapotekischen Dörfern, 60 Kilometer nordöstlich von Stadt Oaxaca. Die indigene Bevölkerung der Dörfer nennt sich selbst „Pueblo de las nubes“, Volk derWolken. Im Jahr 1997 wurde von den Gemeinden das ökotouristische Projekt„Expediciones Sierra Norte“ gegründet (sierranorte.org.mx).
Das Programm bietet den Reisenden die Gelegenheit, das Leben im Süden von Mexiko hautnah mitzuerleben und den natürlichen Reichtum der Region kennenzulernen. Ein insgesamt 100 Kilometer langes Netz aus malerischen Wegen lädt zum Wandern und Moutainbiken ein. Auf Naturfreundewarten Canyons, Höhlen und Wasserfälle und natürlich eine grandiose Panoramaaussicht. Übernachtungsmöglichkeiten in schlichten, aber komfortablen Cabañas sind gegeben und sehr zu empfehlen.